沙眼和结膜炎的治疗用药是不一样的，沙眼的治疗主要针对沙眼衣原体感染选择用药，包括酞丁安滴眼液，利福平滴眼液，氯霉素滴眼液，红霉素眼膏等等，而结膜炎需要根据结膜炎的类型来选择用药，包括治疗细菌性结膜炎的妥布霉素滴眼液，氧氟沙星滴眼液，治疗病毒性结膜炎的利巴韦林滴眼液，阿昔洛韦滴眼液等等，对于过敏性结膜炎，应当选择糖皮质激素类的药物点眼治疗为主。而严重或治疗不当的沙眼，有可能治愈之后留有一些后遗症，比如说上睑下垂，睑球黏连，鼻泪管狭窄或阻塞，泪囊炎等等。沙眼是由沙眼衣原体感染所导致的结膜和角膜的炎症，所以说沙眼是结膜炎当中的一个类型，而结膜炎除了沙眼以外还有病毒性结膜炎，细菌性结膜炎，过敏性结膜炎等等。
